گرومکس

گرومکس (GROMACS) یک مجموعه دینامیک مولکولی است که عمدتاً برای شبیه‌سازی پروتئین‌ها، چربی‌ها و اسیدهای نوکلئیک طراحی شده است. گرومکس ابتدا در سال ۱۹۹۱ توسط گروه شیمی فیزیک دانشگاه گرونینگن هلند پایه‌گذاری شد و در حال حاضر توسط دانشمندان در دانشگاه‌ها و مراکز تحقیقاتی سراسر جهان در حال توسعه است. گرومکس یکی از سریع‌ترین و محبوب‌ترین بسته‌های نرم‌افزاری موجود در عرصه دینامیک مولکولی می‌باشد.

اخبار و آموزش‌های مربوط به این نرم‌افزار در این قسمت فهرست شده اند.

اتصال راه دور توسط SSH

آموزش اتصال راه دور توسط SSH

در آموزش قبلی تحت عنوان راه اندازی SSH بر روی اوبونتو، با تعریف و ضرورت پروتکل SSH و نیز روش راه اندازی SSH بر روی اوبونتو آشنا شدیم. در این نوشته، آموزش اتصال راه دور توسط SSH در سیستم عامل های مختلف را بیان خواهم نمود. اگرچه روشهای متعددی برای این...

راه اندازی SSH بر روی اوبونتو

آموزش راه اندازی SSH بر روی اوبونتو

در این نوشته تلاش می کنم تا آموزش نصب و راه اندازی SSH بر روی اوبونتو را به زبانی ساده برای شما بیان کنم. اما پیش از آن که به جزییات نصب بپردازم، ابتدا با ضرورت این کار و تعریف SSH آشنا شویم. ضرورت اتصال از راه دور به سرور محاسباتی...

نصب FFTW

آموزش نصب FFTW

بسیاری از شبیه سازی های کامپیوتری انجام شده توسط گرومکس با بهره گیری از الگوریتم تبدیل فوریه سریع (FFT) انجام می پذیرد. بنابراین می بایست قبل از اقدام به نصب گرومکس، ابتدا یک کتابخانه نرم افزاری مناسب که توانایی انجام تبدیلات فوریه را داشته باشد، بر روی سیستم نصب کرد....

نصب CMake

آموزش نصب CMake

گرومکس از سیستم نصب کننده CMake برای نصب هسته خود استفاده می کند. به عنوان مثال نسخه ۵.۱.۴ نرم افزار گرومکس که در زمان نوشتار این مطلب، آخرین نسخه از سری ۵ این نرم افزار است بر روی CMake نسخه ۲.۸.۸ یا جدیدتر قابل نصب است. به منظور نصب CMake طبق توضیحات...

نصب اوبونتو در کنار ویندوز

نصب اوبونتو در کنار ویندوز (قسمت سوم)

در قسمت های پیشین این آموزش، با مراحل اولیه جهت اختصاص فضای مناسب برای نصب اوبونتو و نیز روش ساخت یک ابزار قابل بوت آشنا شدیم. در این قسمت از آموزش نصب اوبونتو در کنار ویندوز به سراغ مراحل نصب این سیستم عامل در کنار سیستم عامل ویندوز می رویم....

نصب اوبونتو در کنار ویندوز

نصب اوبونتو در کنار ویندوز (قسمت دوم)

در قسمت قبلی این آموزش آموختیم که چگونه با استفاده از ابزار ویندوز، بخشی از فضای دیسک خود را برای نصب اوبونتو آماده کنیم. در این قسمت از آموزش نصب اوبونتو در کنار ویندوز با نحوه ایجاد یک ابزار قابل بوت جهت نصب اوبونتو آشنا خواهیم شد. ابتدا می بایست فایل...

نصب اوبونتو در کنار ویندوز

نصب اوبونتو در کنار ویندوز (قسمت اول)

از آنجا که عمده کاربران فارسی زبان به سیستم عامل محبوب شرکت مایکروسافت یعنی ویندوز عادت کرده اند، یکی از دغدغه های پژوهشگرانی که می خواهند برای اولین به سمت گرومکس بیایند، چگونگی نصب سیستم عامل گنو لینوکس در کنار ویندوز قبلی شان است. در این آموزش، چگونگی نصب آخرین...

صفحه 2 از مجموع 3 123